Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms