Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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