Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms