Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FHOD3Q2V2M9 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms