Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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GABRA6Q16445 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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GABRA6Q16445 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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GABRA6Q16445 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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GABRA6Q16445 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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GABRA6Q16445 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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GABRA6Q16445 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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