Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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SSX1Q16384 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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SSX1Q16384 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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