Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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NEDD8Q15843 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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