Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TWIST1Q15672 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms