Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTH1Q15438 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTH1Q15438 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTH1Q15438 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTH1Q15438 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTH1Q15438 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTH1Q15438 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTH1Q15438 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms