Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABEP1Q15276 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms