Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms