Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IKBKEQ14164 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms