Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 TCEAL4-213ENST00000613326 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 AC020763.2-201ENST00000623155 1255 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 AP001793.2-201ENST00000580267 780 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 AL117339.1-201ENST00000419779 428 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
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MKRN4PQ13434 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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MKRN4PQ13434 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 LINC01108-202ENST00000635227 776 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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