Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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