Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAF3Q13114 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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TRAF3Q13114 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF3Q13114 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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