Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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