Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms