Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HSPB3Q12988 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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