Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX10Q12887 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX10Q12887 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX10Q12887 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX10Q12887 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX10Q12887 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX10Q12887 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX10Q12887 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX10Q12887 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX10Q12887 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX10Q12887 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX10Q12887 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX10Q12887 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX10Q12887 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX10Q12887 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX10Q12887 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX10Q12887 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX10Q12887 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX10Q12887 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX10Q12887 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX10Q12887 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX10Q12887 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX10Q12887 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX10Q12887 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX10Q12887 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX10Q12887 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX10Q12887 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX10Q12887 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX10Q12887 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX10Q12887 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX10Q12887 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX10Q12887 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX10Q12887 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX10Q12887 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX10Q12887 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX10Q12887 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX10Q12887 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX10Q12887 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX10Q12887 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX10Q12887 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX10Q12887 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX10Q12887 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX10Q12887 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX10Q12887 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX10Q12887 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COX10Q12887 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX10Q12887 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX10Q12887 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX10Q12887 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX10Q12887 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX10Q12887 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX10Q12887 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX10Q12887 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX10Q12887 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX10Q12887 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX10Q12887 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX10Q12887 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX10Q12887 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COX10Q12887 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX10Q12887 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX10Q12887 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX10Q12887 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX10Q12887 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX10Q12887 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX10Q12887 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX10Q12887 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX10Q12887 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX10Q12887 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX10Q12887 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX10Q12887 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX10Q12887 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX10Q12887 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX10Q12887 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COX10Q12887 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX10Q12887 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX10Q12887 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX10Q12887 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX10Q12887 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX10Q12887 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX10Q12887 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX10Q12887 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX10Q12887 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COX10Q12887 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX10Q12887 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX10Q12887 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX10Q12887 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX10Q12887 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX10Q12887 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX10Q12887 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX10Q12887 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX10Q12887 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX10Q12887 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX10Q12887 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX10Q12887 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX10Q12887 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX10Q12887 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX10Q12887 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX10Q12887 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX10Q12887 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX10Q12887 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms