Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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KCNMA1Q12791 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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KCNMA1Q12791 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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KCNMA1Q12791 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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KCNMA1Q12791 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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