Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR1Q08345 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms