Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABPB1Q06547 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms