Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms