Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4A11Q02928 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms