Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms