Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms