Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms