Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms