Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms