Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIM1P81133 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIM1P81133 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIM1P81133 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIM1P81133 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIM1P81133 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIM1P81133 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIM1P81133 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIM1P81133 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIM1P81133 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIM1P81133 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIM1P81133 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIM1P81133 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIM1P81133 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SIM1P81133 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SIM1P81133 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIM1P81133 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIM1P81133 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIM1P81133 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIM1P81133 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIM1P81133 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIM1P81133 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIM1P81133 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIM1P81133 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SIM1P81133 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIM1P81133 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIM1P81133 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIM1P81133 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIM1P81133 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIM1P81133 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIM1P81133 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIM1P81133 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SIM1P81133 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIM1P81133 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIM1P81133 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIM1P81133 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIM1P81133 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIM1P81133 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIM1P81133 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIM1P81133 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SIM1P81133 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIM1P81133 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIM1P81133 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIM1P81133 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIM1P81133 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SIM1P81133 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIM1P81133 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIM1P81133 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIM1P81133 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIM1P81133 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIM1P81133 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SIM1P81133 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIM1P81133 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIM1P81133 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIM1P81133 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIM1P81133 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIM1P81133 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIM1P81133 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIM1P81133 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIM1P81133 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIM1P81133 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIM1P81133 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIM1P81133 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIM1P81133 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIM1P81133 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIM1P81133 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIM1P81133 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIM1P81133 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIM1P81133 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SIM1P81133 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIM1P81133 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIM1P81133 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIM1P81133 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIM1P81133 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIM1P81133 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIM1P81133 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIM1P81133 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIM1P81133 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SIM1P81133 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIM1P81133 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIM1P81133 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIM1P81133 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIM1P81133 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIM1P81133 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIM1P81133 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SIM1P81133 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIM1P81133 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIM1P81133 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIM1P81133 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIM1P81133 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIM1P81133 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIM1P81133 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIM1P81133 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SIM1P81133 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIM1P81133 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIM1P81133 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIM1P81133 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIM1P81133 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIM1P81133 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIM1P81133 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms