Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ARF6P62330 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ARF6P62330 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ARF6P62330 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ARF6P62330 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ARF6P62330 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ARF6P62330 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ARF6P62330 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARF6P62330 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARF6P62330 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ARF6P62330 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms