Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VBP1P61758 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VBP1P61758 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VBP1P61758 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VBP1P61758 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VBP1P61758 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VBP1P61758 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VBP1P61758 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VBP1P61758 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VBP1P61758 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VBP1P61758 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VBP1P61758 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VBP1P61758 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VBP1P61758 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VBP1P61758 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VBP1P61758 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VBP1P61758 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VBP1P61758 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VBP1P61758 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VBP1P61758 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VBP1P61758 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VBP1P61758 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VBP1P61758 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VBP1P61758 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VBP1P61758 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VBP1P61758 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VBP1P61758 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VBP1P61758 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VBP1P61758 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
VBP1P61758 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VBP1P61758 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VBP1P61758 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VBP1P61758 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VBP1P61758 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VBP1P61758 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VBP1P61758 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VBP1P61758 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VBP1P61758 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VBP1P61758 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VBP1P61758 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms