Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms