Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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