Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms