Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC12A2P55011 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC12A2P55011 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms