Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EMP1P54849 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
EMP1P54849 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
EMP1P54849 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EMP1P54849 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EMP1P54849 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EMP1P54849 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms