Protein–RNA interactions for Protein: P51571

SSR4, Translocon-associated protein subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4P51571 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSR4P51571 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSR4P51571 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSR4P51571 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSR4P51571 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSR4P51571 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSR4P51571 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSR4P51571 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSR4P51571 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSR4P51571 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSR4P51571 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSR4P51571 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSR4P51571 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSR4P51571 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSR4P51571 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SSR4P51571 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSR4P51571 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSR4P51571 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSR4P51571 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSR4P51571 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSR4P51571 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSR4P51571 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSR4P51571 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSR4P51571 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSR4P51571 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSR4P51571 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSR4P51571 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSR4P51571 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SSR4P51571 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSR4P51571 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SSR4P51571 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SSR4P51571 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSR4P51571 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSR4P51571 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSR4P51571 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSR4P51571 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSR4P51571 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSR4P51571 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSR4P51571 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSR4P51571 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSR4P51571 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSR4P51571 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR4P51571 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR4P51571 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR4P51571 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR4P51571 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR4P51571 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR4P51571 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR4P51571 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR4P51571 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR4P51571 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR4P51571 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR4P51571 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR4P51571 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR4P51571 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR4P51571 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR4P51571 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR4P51571 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR4P51571 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR4P51571 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR4P51571 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR4P51571 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR4P51571 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR4P51571 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR4P51571 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR4P51571 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSR4P51571 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSR4P51571 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSR4P51571 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSR4P51571 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSR4P51571 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSR4P51571 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSR4P51571 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSR4P51571 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR4P51571 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR4P51571 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR4P51571 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR4P51571 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR4P51571 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR4P51571 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR4P51571 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR4P51571 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR4P51571 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR4P51571 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR4P51571 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR4P51571 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR4P51571 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR4P51571 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR4P51571 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR4P51571 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR4P51571 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR4P51571 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR4P51571 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR4P51571 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR4P51571 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR4P51571 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR4P51571 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR4P51571 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR4P51571 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR4P51571 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms