Protein–RNA interactions for Protein: P48431

SOX2, Transcription factor SOX-2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX2P48431 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX2P48431 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX2P48431 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX2P48431 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX2P48431 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX2P48431 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX2P48431 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX2P48431 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX2P48431 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX2P48431 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX2P48431 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX2P48431 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX2P48431 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX2P48431 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX2P48431 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX2P48431 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX2P48431 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX2P48431 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX2P48431 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX2P48431 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX2P48431 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX2P48431 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX2P48431 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX2P48431 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX2P48431 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX2P48431 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX2P48431 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX2P48431 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX2P48431 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX2P48431 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX2P48431 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX2P48431 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX2P48431 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX2P48431 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX2P48431 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX2P48431 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX2P48431 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX2P48431 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX2P48431 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX2P48431 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX2P48431 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX2P48431 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX2P48431 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX2P48431 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX2P48431 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX2P48431 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX2P48431 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX2P48431 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX2P48431 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX2P48431 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX2P48431 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX2P48431 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX2P48431 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX2P48431 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX2P48431 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX2P48431 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX2P48431 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX2P48431 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX2P48431 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX2P48431 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms