Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms