Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms