Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms