Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRATP43155 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRATP43155 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRATP43155 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRATP43155 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRATP43155 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CRATP43155 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRATP43155 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRATP43155 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRATP43155 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRATP43155 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRATP43155 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRATP43155 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRATP43155 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CRATP43155 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CRATP43155 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRATP43155 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CRATP43155 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRATP43155 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRATP43155 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRATP43155 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRATP43155 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRATP43155 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRATP43155 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRATP43155 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRATP43155 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRATP43155 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRATP43155 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRATP43155 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRATP43155 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRATP43155 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRATP43155 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRATP43155 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRATP43155 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRATP43155 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CRATP43155 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CRATP43155 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CRATP43155 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CRATP43155 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CRATP43155 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CRATP43155 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CRATP43155 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CRATP43155 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CRATP43155 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CRATP43155 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CRATP43155 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CRATP43155 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CRATP43155 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRATP43155 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRATP43155 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRATP43155 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRATP43155 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CRATP43155 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRATP43155 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CRATP43155 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRATP43155 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRATP43155 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRATP43155 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRATP43155 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRATP43155 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRATP43155 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRATP43155 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CRATP43155 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRATP43155 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRATP43155 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRATP43155 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRATP43155 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRATP43155 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRATP43155 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRATP43155 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRATP43155 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRATP43155 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRATP43155 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRATP43155 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CRATP43155 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms