Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms