Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJC1P36383 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GJC1P36383 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJC1P36383 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJC1P36383 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJC1P36383 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJC1P36383 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJC1P36383 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJC1P36383 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJC1P36383 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJC1P36383 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJC1P36383 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJC1P36383 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJC1P36383 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJC1P36383 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJC1P36383 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJC1P36383 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJC1P36383 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJC1P36383 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJC1P36383 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJC1P36383 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJC1P36383 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJC1P36383 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJC1P36383 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJC1P36383 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJC1P36383 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJC1P36383 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GJC1P36383 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJC1P36383 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJC1P36383 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJC1P36383 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJC1P36383 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJC1P36383 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJC1P36383 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJC1P36383 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJC1P36383 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GJC1P36383 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJC1P36383 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJC1P36383 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJC1P36383 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJC1P36383 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJC1P36383 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJC1P36383 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJC1P36383 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJC1P36383 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJC1P36383 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJC1P36383 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJC1P36383 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJC1P36383 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJC1P36383 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJC1P36383 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJC1P36383 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJC1P36383 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJC1P36383 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJC1P36383 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJC1P36383 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJC1P36383 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJC1P36383 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJC1P36383 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJC1P36383 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJC1P36383 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJC1P36383 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJC1P36383 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJC1P36383 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJC1P36383 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJC1P36383 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJC1P36383 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJC1P36383 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJC1P36383 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJC1P36383 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJC1P36383 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJC1P36383 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJC1P36383 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJC1P36383 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJC1P36383 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJC1P36383 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJC1P36383 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJC1P36383 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJC1P36383 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJC1P36383 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJC1P36383 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJC1P36383 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJC1P36383 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJC1P36383 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJC1P36383 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJC1P36383 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJC1P36383 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJC1P36383 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJC1P36383 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GJC1P36383 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJC1P36383 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJC1P36383 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJC1P36383 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJC1P36383 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJC1P36383 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJC1P36383 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJC1P36383 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GJC1P36383 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJC1P36383 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJC1P36383 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms