Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP214P35658 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP214P35658 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP214P35658 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP214P35658 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP214P35658 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP214P35658 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP214P35658 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP214P35658 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP214P35658 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP214P35658 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP214P35658 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP214P35658 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP214P35658 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP214P35658 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP214P35658 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP214P35658 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP214P35658 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP214P35658 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP214P35658 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP214P35658 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP214P35658 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP214P35658 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP214P35658 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP214P35658 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP214P35658 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP214P35658 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP214P35658 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP214P35658 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP214P35658 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP214P35658 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP214P35658 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP214P35658 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP214P35658 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP214P35658 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP214P35658 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP214P35658 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP214P35658 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP214P35658 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP214P35658 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP214P35658 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP214P35658 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP214P35658 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP214P35658 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP214P35658 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms