Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 FAM122B-208ENST00000611027 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.612e-9■■■□□ 16
GTF2F1P35269 FAM122B-207ENST00000493333 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.722e-9■■■□□ 16
GTF2F1P35269 NUMBL-205ENST00000598759 2062 nt30.67■■■□□ 2.51e-7■■■□□ 16
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GTF2F1P35269 NUMBL-206ENST00000598773 834 ntTSL 524.29■■□□□ 1.481e-7■■■□□ 16
GTF2F1P35269 GALE-209ENST00000467070 556 ntTSL 322.58■■□□□ 1.211e-7■■■□□ 16
GTF2F1P35269 GALE-208ENST00000466250 598 ntTSL 222.28■■□□□ 1.161e-7■■■□□ 16
GTF2F1P35269 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.051e-7■■■□□ 16
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GTF2F1P35269 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.851e-7■■■□□ 16
GTF2F1P35269 GALE-202ENST00000418277 882 ntTSL 519.2■□□□□ 0.661e-7■■■□□ 16
GTF2F1P35269 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.571e-7■■■□□ 16
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GTF2F1P35269 HBP1-213ENST00000497535 702 ntTSL 214.52□□□□□ -0.091e-7■■■□□ 16
GTF2F1P35269 GALE-214ENST00000481736 1801 ntTSL 212.55□□□□□ -0.41e-7■■■□□ 16
GTF2F1P35269 KLHDC10-203ENST00000468226 772 ntTSL 37.86□□□□□ -1.151e-7■■■□□ 16
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GTF2F1P35269 FDPS-217ENST00000492244 673 ntTSL 313.37□□□□□ -0.271e-13■■■□□ 15.9
GTF2F1P35269 FDPS-218ENST00000492887 554 ntTSL 28.3□□□□□ -1.081e-13■■■□□ 15.9
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GTF2F1P35269 PRSS21-210ENST00000577043 814 ntTSL 520.32■□□□□ 0.841e-7■■■□□ 15.9
GTF2F1P35269 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.083e-6■■■□□ 15.9
GTF2F1P35269 FOXP4-201ENST00000307972 3745 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.182e-6■■■□□ 15.9
GTF2F1P35269 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.592e-8■■■□□ 15.9
GTF2F1P35269 EME2-203ENST00000564182 549 ntTSL 321.66■■□□□ 1.067e-7■■■□□ 15.9
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GTF2F1P35269 RUSC1-206ENST00000462780 2420 ntTSL 220.28■□□□□ 0.845e-10■■■□□ 15.9
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GTF2F1P35269 RUSC1-216ENST00000497930 1156 ntTSL 319.46■□□□□ 0.715e-10■■■□□ 15.9
GTF2F1P35269 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.625e-10■■■□□ 15.9
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GTF2F1P35269 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.65e-10■■■□□ 15.9
GTF2F1P35269 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.495e-10■■■□□ 15.9
GTF2F1P35269 RUSC1-213ENST00000489860 934 ntTSL 518.08■□□□□ 0.485e-10■■■□□ 15.9
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GTF2F1P35269 LSS-203ENST00000419093 517 ntTSL 310.32□□□□□ -0.766e-11■■■□□ 15.8
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GTF2F1P35269 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.344e-7■■■□□ 15.8
GTF2F1P35269 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.14e-7■■■□□ 15.8
GTF2F1P35269 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.111e-9■■■□□ 15.8
GTF2F1P35269 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.061e-9■■■□□ 15.8
GTF2F1P35269 ARHGEF2-215ENST00000487755 2176 ntTSL 216.14■□□□□ 0.178e-7■■■□□ 15.8
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GTF2F1P35269 PDLIM7-214ENST00000505746 405 ntTSL 513.57□□□□□ -0.248e-7■■■□□ 15.8
GTF2F1P35269 PIP4K2B-203ENST00000617781 927 ntTSL 212.82□□□□□ -0.361e-9■■■□□ 15.8
GTF2F1P35269 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.352e-6■■■□□ 15.8
GTF2F1P35269 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.785e-10■■■□□ 15.8
GTF2F1P35269 LMAN2-207ENST00000514458 616 ntTSL 523.49■■□□□ 1.355e-10■■■□□ 15.8
GTF2F1P35269 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.255e-10■■■□□ 15.8
GTF2F1P35269 LMAN2-204ENST00000504071 562 ntTSL 219.58■□□□□ 0.725e-10■■■□□ 15.8
GTF2F1P35269 SREBF1-206ENST00000423161 1058 ntTSL 320.88■□□□□ 0.934e-11■■■□□ 15.8
GTF2F1P35269 SREBF1-211ENST00000476994 591 ntTSL 219.07■□□□□ 0.644e-11■■■□□ 15.8
GTF2F1P35269 SREBF1-222ENST00000583732 580 ntTSL 417.25■□□□□ 0.354e-11■■■□□ 15.8
GTF2F1P35269 SLC7A6-202ENST00000379152 5074 ntTSL 1 (best)10.82□□□□□ -0.681e-7■■■□□ 15.8
GTF2F1P35269 SLC7A6-201ENST00000219343 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.961e-7■■■□□ 15.8
GTF2F1P35269 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.11e-7■■■□□ 15.8
GTF2F1P35269 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.111e-7■■■□□ 15.8
GTF2F1P35269 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.133e-8■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 INTS6-207ENST00000469430 3767 ntTSL 214.48□□□□□ -0.093e-8■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 INTS6-209ENST00000483288 597 ntTSL 410.13□□□□□ -0.793e-8■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.823e-8■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.053e-8■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 INTS6-212ENST00000485178 474 ntTSL 55.03□□□□□ -1.63e-8■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 RANBP1-214ENST00000488484 699 ntTSL 216.95■□□□□ 0.33e-12■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 UBE2D3-214ENST00000503282 584 ntTSL 223.96■■□□□ 1.437e-7■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 UBE2D3-216ENST00000503742 1977 ntTSL 1 (best)23.7■■□□□ 1.387e-7■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.377e-7■■■□□ 15.7
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