Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP6P35125 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP6P35125 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP6P35125 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP6P35125 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP6P35125 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP6P35125 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP6P35125 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP6P35125 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP6P35125 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP6P35125 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP6P35125 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP6P35125 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP6P35125 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP6P35125 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP6P35125 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP6P35125 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP6P35125 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP6P35125 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP6P35125 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP6P35125 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP6P35125 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP6P35125 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP6P35125 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP6P35125 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP6P35125 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
USP6P35125 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP6P35125 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP6P35125 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP6P35125 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
USP6P35125 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP6P35125 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP6P35125 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP6P35125 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP6P35125 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP6P35125 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP6P35125 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP6P35125 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP6P35125 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP6P35125 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP6P35125 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP6P35125 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP6P35125 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP6P35125 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP6P35125 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP6P35125 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP6P35125 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP6P35125 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP6P35125 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6P35125 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6P35125 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6P35125 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6P35125 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6P35125 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6P35125 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6P35125 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6P35125 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6P35125 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6P35125 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6P35125 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6P35125 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6P35125 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6P35125 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6P35125 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6P35125 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6P35125 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6P35125 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6P35125 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6P35125 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6P35125 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6P35125 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6P35125 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6P35125 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6P35125 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6P35125 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP6P35125 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP6P35125 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP6P35125 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP6P35125 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP6P35125 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP6P35125 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP6P35125 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP6P35125 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP6P35125 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP6P35125 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP6P35125 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP6P35125 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP6P35125 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP6P35125 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP6P35125 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP6P35125 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP6P35125 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP6P35125 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP6P35125 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP6P35125 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP6P35125 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP6P35125 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP6P35125 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP6P35125 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP6P35125 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms