Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms