Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTX3P26022 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTX3P26022 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTX3P26022 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTX3P26022 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTX3P26022 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTX3P26022 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTX3P26022 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTX3P26022 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTX3P26022 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTX3P26022 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTX3P26022 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTX3P26022 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTX3P26022 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTX3P26022 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTX3P26022 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTX3P26022 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTX3P26022 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms